RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUP98P52948 1817 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F6UZH7 168 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ENSAO43768 121 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 P2RX1P51575 399 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EMC4Q5J8M3 183 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS45Q7RTY3 260 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR14Q9BWN1 585 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXL4Q9UKA2 621 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD27P26842 260 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACVR1Q04771 509 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM26EQ8N5C1 309 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1E3Q8WZA6 343 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNJ15Q99712 375 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KPTNQ9Y664 436 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SOCS7O14512 581 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIX6O95475 246 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL3RAP26951 378 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFA6P56556 154 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 METRNLQ641Q3 311 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IMPA2O14732 288 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPINT2O43291 252 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AFMIDQ63HM1 303 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC35G3Q8N808 338 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MS4A6EQ96DS6 147 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMX2A2RU54 273 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C4orf47A7E2U8 309 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAAR5O14804 337 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ICMTO60725 284 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUSP5Q16690 384 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CADM3Q8N126 398 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4Q3Q8NH05 313 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARV1Q9H2C2 271 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1B0GX78 115 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPE2 198 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PR64 198 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRV1 198 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAF1P04049 648 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SBK2P0C263 348 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EDN3P14138 238 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCSK6P29122 969 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPMTP51580 245 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAGE3Q86Y29 109 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAGE2Q86Y30 109 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBE2FQ969M7 185 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAS2R4Q9NYW5 299 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHLDA2Q53GA4 152 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OLIG3Q7RTU3 272 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSF3RQ99062 836 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCRBV5S2A0A599 114 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALOX12BO75342 701 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRPH2P23942 346 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUSP1P28562 367 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPHA5P54756 1037 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADIRFQ15847 76 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VHLLQ6RSH7 139 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYT13Q7L8C5 426 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SKA3Q8IX90 412 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM99Q8N816 258 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC22A12Q96S37 553 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HPNP05981 417 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OXA1LQ15070 435 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX19Q8NA77 164 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIPHQ8WWY8 451 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms