RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 CITED4Q96RK1 184 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 A6NIZ1 184 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 H0YC42 278 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 WISP1O95388 367 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CTLA4P16410 223 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP1BP61224 184 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP1AP62834 184 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 MEIOBQ8N635 442 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 DHDHQ9UQ10 334 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 LINC00862A6NCI5 91 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDOBP05062 364 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 SDHBP21912 280 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 GLO1Q04760 184 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ESCO2Q56NI9 601 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC22CQ9BRL7 303 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 FGF21Q9NSA1 209 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFRSF10AO00220 468 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 IFNA7P01567 189 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 POU3F4P49335 361 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF81P51508 661 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZP4Q12836 540 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 PLA2G7Q13093 441 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF626Q68DY1 528 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ST8SIA1Q92185 356 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 ABHD6Q9BV23 337 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CKLFQ9UBR5 152 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-202ENST00000399409 CD2P06729 351 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 C4BPBP20851 252 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP2K6P52564 334 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF4P78317 190 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM166AQ6J272 317 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF69Q9UC07 566 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 G3V3Q6 166 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 PNPP00491 289 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 TDHQ8IZJ6 230 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52N5Q8NH56 324 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM10O14672 748 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGA5P08648 1049 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 FSTP19883 344 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 IGFBP4P22692 258 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 P2RX3P56373 397 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP2BP61225 183 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 CTSFQ9UBX1 484 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 CIB4A0PJX0 185 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 H3BSH0 61 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 DHODHQ02127 395 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM225Q6GV28 225 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 LRP12Q9Y561 859 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 LEUTXA8MZ59 168 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 CD37P11049 281 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 EFNB2P52799 333 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 SNTA1Q13424 505 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 MELKQ14680 651 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-202ENST00000399409 ETFDHQ16134 617 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms