RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf198Q9H425 327 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF224Q9NZL3 707 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HCFC1P51610 2035 aa13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHISA9B4DS77 424 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H7C1C5 153 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAF1P04049 648 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53P04637 393 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CECR9P0C854 216 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTLA4P16410 223 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSR1P21757 451 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP16P51512 607 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN26Q16670 478 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEG1Q6P5S2 330 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A25Q6T423 547 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT9Q86SS6 491 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HS3ST5Q8IZT8 346 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRTOMTQ8WZ04 291 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX12Q9BXU0 123 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RACGAP1Q9H0H5 632 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLE4Q9NR33 117 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL21Q9UJP4 597 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP7Q9Y680 259 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBN2P35556 2912 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNA1CQ13936 2221 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPL8 197 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYSRT1A8MQ03 144 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf71A8MTZ7 269 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BN98 237 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINA5P05154 406 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CST2P09228 141 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF23P17027 643 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKACGP22612 351 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDH11P55287 796 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBA1BP68363 451 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KEAP1Q14145 624 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGCAQ16586 387 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC36A3Q495N2 470 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC27A4Q6P1M0 643 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBA1AQ71U36 451 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KBTBD8Q8NFY9 601 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4F15Q8NGB8 312 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52E2Q8NGJ4 325 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4K13Q8NH42 304 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIIAD1A6NNX1 92 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BNX3 289 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLAUP00749 431 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGN1P05114 100 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSM6P62312 80 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESRRGP62508 458 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLO1Q04760 184 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLP2Q04941 152 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPRL3Q12980 569 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNMB1Q16558 191 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGGHGQ32M88 737 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF544Q6NX49 715 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.29□□□□□ -0.28
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