RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PMP2P02689 132 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OXA1LQ15070 435 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LIPHQ8WWY8 451 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC7A6Q92536 515 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB22AQ9UL26 194 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NINQ8N4C6 2090 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0A6YYD5 115 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM221A6NGB7 291 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 H0YIG0 161 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 YKT6O15498 198 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A12P80511 92 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ACSM1Q08AH1 577 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FAPQ12884 760 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB31Q13636 194 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 EXT1Q16394 746 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52I2Q8NH67 350 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MCM3APO60318 1980 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM166BA8MTA8 275 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EPK0 472 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFSF4P23510 183 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 EMDP50402 254 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DYRK1AQ13627 763 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PLGLAQ15195 96 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf85Q9H1P6 137 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MED29Q9NX70 200 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GABRG2P18507 467 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 AMER3Q8N944 861 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX18Q96RF0 628 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MPPED1O15442 326 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYZL1O95825 349 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGB2P05107 769 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 WNT3P56703 355 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MC2RQ01718 297 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM53BQ14153 422 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SGK3Q96BR1 496 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GCM1Q9NP62 436 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CHST11Q9NPF2 352 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PS29 197 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NPY4RP50391 375 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DGCR2P98153 550 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PGAP1Q75T13 922 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OCEL1Q9H607 264 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GLTPQ9NZD2 209 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF814B7Z6K7 855 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 STK17BO94768 372 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NAGAP17050 411 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH3B1P43353 468 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10A3P58181 314 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 BATF2Q8N1L9 274 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP13Q9UII6 198 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 KCND3Q9UK17 655 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CD160O95971 181 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB4BP61018 213 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0B4J203 849 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CD79BP40259 229 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL11P51671 97 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms