RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391014.1

RNU6-1228P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1228, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1228P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NTAN1Q96AB6 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C7orf34Q96L11 122 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NSMCE2Q96MF7 247 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR52D1Q9H346 318 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SYTL2Q9HCH5 934 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC17A5Q9NRA2 495 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C21orf62Q9NYP8 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IL36GQ9NZH8 169 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GNG12Q9UBI6 72 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR51B4Q9Y5P0 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 R4GN34 69 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 UBE4BO95155 1302 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KDRP35968 1356 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CEACAM18A8MTB9 384 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SYNGR2O43760 224 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR4F21O95013 312 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 S1PR2O95136 353 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 LCA5LO95447 670 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGKV1-39P01597 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGKV1D-39P04432 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CALM1P0DP23 149 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CALM2P0DP24 149 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CALM3P0DP25 149 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FUT1P19526 365 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IMPDH1P20839 514 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HLA-DMAP28067 261 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SFNP31947 248 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SSTR5P35346 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 UQCRFS1P47985 274 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FMODQ06828 376 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PPIL2Q13356 520 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KCTD21Q4G0X4 260 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MED27Q6P2C8 311 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TEX43Q6ZNM6 134 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ACOT1Q86TX2 421 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF101Q8IZC7 436 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TTLQ8NG68 377 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KRT35Q92764 455 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TMEM186Q96B77 213 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SEH1LQ96EE3 360 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RNF2Q99496 336 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TIMM17AQ99595 171 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CHCHD7Q9BUK0 85 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C2orf40Q9H1Z8 148 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DPH5Q9H2P9 285 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MID1IP1Q9NPA3 183 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TMOD2Q9NZR1 351 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 USP24Q9UPU5 2620 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ANKRD12Q6UB98 2062 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRR14LQ5THK1 2151 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF726A6NNF4 738 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HIDE1A8MVS5 230 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 A8MXQ7 604 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HAS3O00219 553 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GLSO94925 669 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AP2A1O95782 977 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGLV3-25P01717 112 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HEXBP07686 556 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CT62P0C5K7 136 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR8U9P0C7N5 309 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RAB3BP20337 219 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC2A5P22732 501 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 LOXP28300 417 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ADRA1AP35348 466 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OPRD1P41143 372 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EIF1P41567 113 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 P2RY1P47900 373 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CASP4P49662 377 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRLHRP49683 370 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF138P52744 262 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OGDHQ02218 1023 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C2orf54Q08AI8 447 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SCRN3Q0VDG4 424 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRDX4Q13162 271 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DOC2AQ14183 400 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DUSP7Q16829 419 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TMEM69Q5SWH9 247 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PLET1Q6UQ28 207 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 LIX1Q8N485 282 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 STXBP6Q8NFX7 210 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR52H1Q8NGJ2 320 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR52B4Q8NGK2 314 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 BLNKQ8WV28 456 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM3DQ96BQ1 224 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MED8Q96G25 268 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 P2RX4Q99571 388 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms