RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 HMGN4O00479 90 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 PLPP1O14494 284 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 CD37P11049 281 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 C15orf54Q8N8G6 183 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM4Q8WVI0 70 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 AK3Q9UIJ7 227 aa17.08■□□□□ 0.33
AMIGO1-202ENST00000369864 MCRIP1C9JLW8 97 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 TGOLN2O43493 480 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CD3DP04234 171 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RABIFP47224 123 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 F2RL1P55085 397 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NKG7Q16617 165 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 C4orf17Q53FE4 359 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 OR8D4Q8NGM9 314 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CPT1CQ8TCG5 803 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CLN5O75503 358 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 MORN1Q5T089 497 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CXCL16Q9H2A7 254 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CREBZFQ9NS37 354 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD61A6NGH8 418 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ALOX5APP20292 161 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 PTAFRP25105 342 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 APLNRP35414 380 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 FABP6P51161 128 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CATR1Q13166 79 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 PHYHD1Q5SRE7 291 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM185AQ8N0U4 392 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ABHD6Q9BV23 337 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 AKAP11Q9UKA4 1901 aa17.08■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ARRDC5A6NEK1 342 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL2L11O43521 198 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SOD1P00441 154 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 MBP02144 154 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 AFMIDQ63HM1 303 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 OR52B4Q8NGK2 314 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 HSD17B8Q92506 261 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SEH1LQ96EE3 360 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF385DQ9H6B1 395 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF186Q9NXI6 227 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 HRO43593 1189 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CSF2RBP32927 897 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 C17orf99Q6UX52 265 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 DBX2Q6ZNG2 339 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC6A17Q9H1V8 727 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 OR6C68A6NDL8 312 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 THBS3P49746 956 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 DCAF7P61962 342 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC7A9P82251 487 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 H3F3AP84243 136 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ADGRG3Q86Y34 549 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 FKRPQ9H9S5 495 aa17.07■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 KLK8O60259 260 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL12P30050 165 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 MFAP5Q13361 173 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RAB9BQ9NP90 201 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NECAP2Q9NVZ3 263 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 KLK11Q9UBX7 282 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CHD4Q14839 1912 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CYB5BO43169 146 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SEMA4FO95754 770 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 IRF2P14316 349 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF385BQ569K4 471 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SYS1Q8N2H4 156 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM19Q96E16 107 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CACNA1SQ13698 1873 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 MMP15P51511 669 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 CTBSQ01459 385 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 UQCC3Q6UW78 93 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 ASB13Q8WXK3 278 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 WWTR1Q9GZV5 400 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 NXPH3O95157 252 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 RAB38P57729 211 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR85P60893 370 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00303Q3SY05 128 aa17.06■□□□□ 0.32
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2T2Q6IF00 324 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms