RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SPHARQ15513 63 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EOGTQ5NDL2 527 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PXDC1Q5TGL8 231 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD17BQ5VST6 288 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MLIPQ5VWP3 458 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CARM1Q86X55 608 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 THAP8Q8NA92 274 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR7G1Q8NGA0 311 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RNF128Q8TEB7 428 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO2A1Q92959 643 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OTUB2Q96DC9 234 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC29A3Q9BZD2 475 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DCLK3Q9C098 648 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP57Q9NU63 452 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AHSPQ9NZD4 102 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FOXJ2Q9P0K8 574 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SNX12Q9UMY4 172 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMED7Q9Y3B3 224 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ASB4Q9Y574 426 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CDHR2Q9BYE9 1310 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM172BPA6NC97 362 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A20A6NK97 555 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RFPL4AA6NLU0 287 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GLRA3O75311 464 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SEC24AO95486 1093 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1G2O95670 118 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BCHEP06276 602 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RHOCP08134 193 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CETPP11597 493 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ABOP16442 354 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TBXA2RP21731 343 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MMP11P24347 488 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GIFP27352 417 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HOXA9P31269 272 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TNFSF8P32971 234 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SPRP35270 261 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DLSTP36957 453 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GDF5P43026 501 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PTH2RP49190 550 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NECTIN1Q15223 517 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MICBQ29980 383 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFAF6Q330K2 333 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR8G2PQ6IF36 304 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HSDL2Q6YN16 418 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SHFQ7M4L6 423 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF546Q86UE3 836 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM72BQ86X60 149 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC34A3Q8N130 599 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 STK40Q8N2I9 435 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RAB42Q8N4Z0 105 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EMC1Q8N766 993 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR4Q3Q8NH05 313 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR5B3Q8NH48 314 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TERB2Q8NHR7 220 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HCAR2Q8TDS4 363 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RXFP2Q8WXD0 754 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SMARCD2Q92925 531 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF14Q92956 283 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NAT6Q93015 286 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PIGTQ969N2 578 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM18Q96B42 140 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BORCS7Q96B45 105 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ASB9Q96DX5 294 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRG7Q96K78 797 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SFXN2Q96NB2 322 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MCEEQ96PE7 176 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FCRL5Q96RD9 977 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ADOQ96SZ5 270 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UQCC2Q9BRT2 126 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LXNQ9BS40 222 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NMUR2Q9GZQ4 415 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 272.3 ms