RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.46■□□□□ 0.23
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SPNS3-201ENST00000355530 REG4Q9BYZ8 158 aa16.46■□□□□ 0.23
SPNS3-201ENST00000355530 UCK1Q9HA47 277 aa16.46■□□□□ 0.23
SPNS3-201ENST00000355530 CKLFQ9UBR5 152 aa16.46■□□□□ 0.23
SPNS3-201ENST00000355530 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.46■□□□□ 0.23
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SPNS3-201ENST00000355530 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS3-201ENST00000355530 GP1BBP13224 206 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS3-201ENST00000355530 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS3-201ENST00000355530 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS3-201ENST00000355530 C4orf46Q504U0 113 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.43■□□□□ 0.22
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