RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355522.5

C2CD4A-201, Transcript of C2 calcium dependent domain containing 4A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C2CD4A, Length 3,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4A-201ENST00000355522 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.77□□□□□ -0.04
C2CD4A-201ENST00000355522 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
C2CD4A-201ENST00000355522 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.77□□□□□ -0.04
C2CD4A-201ENST00000355522 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 LILRB5O75023 590 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 EML2O95834 649 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ADCYAP1P18509 176 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CALCRP30988 508 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TAS2R19P59542 299 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.77□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TBX19O60806 448 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 FKTNO75072 461 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 MED6O75586 246 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CTAG2O75638 210 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 NID1P14543 1247 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 RAB28P51157 221 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ERV3-1Q14264 604 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 MLC1Q15049 377 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 RNF141Q8WVD5 230 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 FGF13Q92913 245 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PRR13Q9NZ81 148 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CPED1A4D0V7 1026 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 OIP5O43482 229 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 AGR2O95994 175 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ST6GAL1P15907 406 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SPOCK1Q08629 439 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 S100PBPQ96BU1 408 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 C11orf98E9PRG8 122 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 HPGDP15428 266 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 RAB6AP20340 208 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 GRK6P43250 576 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 DIO1P49895 249 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SGCGQ13326 291 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 LILRA6Q6PI73 481 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZAR1Q86SH2 424 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 GPR148Q8TDV2 347 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PHB2Q99623 299 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 JAM3Q9BX67 310 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 MSRAQ9UJ68 235 aa14.76□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CMPK1P30085 196 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CTXN1P60606 82 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 IL10RAQ13651 578 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CSRP2Q16527 193 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CLCC1Q96S66 551 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 CKLFQ9UBR5 152 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PI3P19957 117 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZNF77Q15935 545 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 OR52W1Q6IF63 320 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PTAFRP25105 342 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 DNASE1L1P49184 302 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 VEGFBP49765 207 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 BAP18Q8IXM2 172 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 LCN9Q8WX39 176 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 RHOFQ9HBH0 211 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.75□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 SFTPBP07988 381 aa14.74□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 HSD17B2P37059 387 aa14.74□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 GNALP38405 381 aa14.74□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 BIKQ13323 160 aa14.74□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 PPP1R1AQ13522 171 aa14.74□□□□□ -0.05
C2CD4A-201ENST00000355522 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms