RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339711.8

PRDM8-201, Transcript of PR/SET domain 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM8, Length 4,095 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8-201ENST00000339711 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ALG1L2C9J202 215 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CSF3P09919 207 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CRYBB2P43320 205 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PGAM5Q96HS1 289 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 WDR76Q9H967 626 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 F5H5K5 113 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 AMY2BP19961 511 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MSX1P28360 303 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 S100GP29377 79 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 GPR50Q13585 617 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ACBD4Q8NC06 268 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 GON7Q9BXV9 100 aa14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 B4DXG7 233 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 H7C2Y5 167 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 BHLHE40O14503 412 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SYT7O43581 403 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CD34P28906 385 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PI4KAP42356 2102 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 LTBQ06643 244 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CDK10Q15131 360 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 RDH10Q8IZV5 341 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MEMO1Q9Y316 297 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 GPR176Q14439 515 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 AWAT2Q6E213 333 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 COPS3Q9UNS2 423 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SDK2Q58EX2 2172 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ARPC3O15145 178 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SC5DO75845 299 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF28P17035 718 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 EXT1Q16394 746 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 LIPNQ5VXI9 398 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.94□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ICAM2P13598 275 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 DPP4P27487 766 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MFSD4AQ8N468 514 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 PTP4A1Q93096 173 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SFXN2Q96NB2 322 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 APMAPQ9HDC9 416 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 BRCA2P51587 3418 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 HTR3BO95264 441 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TGM1P22735 817 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 DGCR2P98153 550 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 BDH1Q02338 343 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 MEP1BQ16820 701 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ST8SIA1Q92185 356 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 LANCL2Q9NS86 450 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 AKR7A3O95154 331 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ACTBP60709 375 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ACTG1P63261 375 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 IL11RAQ14626 422 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 EMC4Q5J8M3 183 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TOMM40LQ969M1 308 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 TAAR8Q969N4 342 aa14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 IFI6P09912 130 aa14.92□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 BIDP55957 195 aa14.92□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.92□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.92□□□□□ -0.02
PRDM8-201ENST00000339711 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms