RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 MED29Q9NX70 200 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GNG8Q9UK08 70 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TVP23AA6NH52 213 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL15A6NJ78 407 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT7O00154 380 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFSF11O14788 317 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OGG1O15527 345 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LALBAP00709 142 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA3P01011 423 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HRGP04196 525 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CTLA4P16410 223 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ALOX5APP20292 161 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ENPP1P22413 925 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CD79BP40259 229 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RORCP51449 518 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RUNX1T1Q06455 604 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 POU4F3Q15319 338 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53I3Q53FA7 332 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF766Q5HY98 468 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 VASNQ6EMK4 673 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC20BQ86Y33 519 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOSQ8NHW6 89 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 THEM6Q8WUY1 208 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC6Q9BV81 110 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TMED9Q9BVK6 235 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT8Q9NY28 637 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PINLYPA6NC86 204 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPB2A8KAH6 182 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1AP01583 271 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CD1AP06126 327 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GAAP10253 952 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A5P33763 92 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TGM4P49221 684 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 STARP49675 285 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ENTPD1P49961 510 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MEOX1P50221 254 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GFRA1P56159 465 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM8P78325 824 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC20Q12834 499 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK2DQ13557 499 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPB2Q16082 182 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2A1Q16548 175 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF404Q494X3 552 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX30Q5JUR7 227 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF544Q6NX49 715 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL9Q6T311 187 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MCFD2Q8NI22 146 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD4Q8TB40 342 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TM9SF2Q99805 663 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MROQ9BYG7 248 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 COPS3Q9UNS2 423 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPK2Q86TB3 2170 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRIN2O60269 458 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms