RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF208O43345 1280 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CBR3O75828 277 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 M6PRP20645 277 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 THAP4Q8WY91 577 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 IFT22Q9H7X7 185 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01387J3KSC0 135 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 MT-ND5P03915 603 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEA5P43359 124 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 LIMK1P53667 647 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 PMP22Q01453 160 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TPBGQ13641 420 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 DGUOKQ16854 277 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TIGD4Q8IY51 512 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T4Q8NH00 348 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GHSRQ92847 366 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SFXN2Q96NB2 322 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GABRPO00591 440 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 RGS5O15539 181 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TXNDC12O95881 172 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 P2RY4P51582 365 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 FOXO1Q12778 655 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 RNLSQ5VYX0 342 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 UTS2BQ765I0 119 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 OR52N1Q8NH53 320 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ASB10Q8WXI3 467 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 BRD7Q9NPI1 651 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 PIEZO1Q92508 2521 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SLC30A4O14863 429 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 IGF2P01344 180 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 BMP4P12644 408 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CEACAM1P13688 526 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ADAM8P78325 824 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SELENBP1Q13228 472 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.8□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SPTA1P02549 2419 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CXCL13O43927 109 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ALX3O95076 343 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SNX4O95219 450 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T7P0C7T2 308 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 EDNRAP25101 427 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TPTEP56180 551 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CLDN15P56746 228 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CLDN17P56750 224 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 UEVLDQ8IX04 471 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 OR2M7Q8NG81 312 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T27Q8NH04 317 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 EMC7Q9NPA0 242 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.79□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-9P01782 118 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms