RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF32Q9H0A6 362 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP28Q9H239 520 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf10Q9HB07 376 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DIABLOQ9NR28 239 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRN3E7EW58 273 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SCDO00767 359 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PHYHO14832 338 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G10O15496 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TPPPO94811 219 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GLCEO94923 617 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UBL3O95164 117 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RENP00797 406 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSBP07858 339 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UBL4AP11441 157 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GAL1P15907 406 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ELK1P19419 428 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT1P19526 365 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP20933 346 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 S1PR1P21453 382 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SHC1P29353 583 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PYCR1P32322 319 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CD79BP40259 229 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TGM4P49221 684 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPAP49450 140 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EMDP50402 254 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A1P53007 311 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP6P55212 293 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RAG2P55895 527 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CAV3P56539 151 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRPAP78324 504 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RBPJQ06330 500 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT7Q11130 342 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MFAP5Q13361 173 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EFR3AQ14156 821 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GRM7Q14831 915 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK5R1Q15078 307 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK10Q15131 360 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CDONQ4KMG0 1287 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC4Q5J8M3 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PXKQ7Z7A4 578 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LUZP2Q86TE4 346 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ACBD4Q8NC06 268 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MVB12AQ96EY5 273 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX11GQ96HA9 241 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ15Q99712 375 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXC2Q99958 501 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 WACQ9BTA9 647 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MED28Q9H204 178 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10A5Q9H207 317 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LIME1Q9H400 295 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL1Q9NR64 748 aa6.33□□□□□ -1.4
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