RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NR0B2Q15466 257 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM17Q86X19 198 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPR148Q8TDV2 347 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR2A7Q96R45 310 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MPZL1O95297 269 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RAB11BQ15907 218 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TMPPEQ6ZT21 453 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 BIVMQ86UB2 503 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF175Q9Y473 711 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FBXO24O75426 580 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 THBS1P07996 1170 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IL13RA1P78552 427 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 BAMBIQ13145 260 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DHRS2Q13268 280 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IGSF11Q5DX21 431 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SHEQ5VZ18 495 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SYS1Q8N2H4 156 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DEFB119Q8N690 84 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NUBPLQ8TB37 319 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DCUN1D4Q92564 292 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RAB7BQ96AH8 199 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 APOOQ9BUR5 198 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MSRAQ9UJ68 235 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LINC01565O15544 149 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LMX1BO60663 402 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CNR1P21554 472 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PSG6Q00889 435 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPR18Q14330 331 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CORO6Q6QEF8 472 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HERVK_113Q902F9 699 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FGF14Q92915 247 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 B9D1Q9UPM9 204 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CPED1A4D0V7 1026 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR2T1O43869 369 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPRIN2O60269 458 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CPN1P15169 458 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PGAM2P15259 253 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IGFALSP35858 605 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DNASE1L1P49184 302 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ADPRHP54922 357 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 WDR38Q5JTN6 314 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C2orf72A6NCS6 295 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TPPPO94811 219 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GLCEO94923 617 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ABHD13Q7L211 337 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ELP5Q8TE02 316 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SERINC2Q96SA4 455 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 XRCC3O43542 346 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC16A7O60669 478 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CSF1P09603 554 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 S100A10P60903 97 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 URADA6NGE7 173 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 XKRYO14609 159 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ABCD4O14678 606 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms