RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPDH	A6ND91	283 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NJY4	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM166B	A8MTA8	275 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495		G3V3Q6	166 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SOCS6	O14544	535 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAMEF2	O60811	474 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CBR1	P16152	277 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRB1	P18505	474 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NPR2	P20594	1047 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCRC2	P22695	453 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD3B2	P26439	372 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	MSX1	P28360	303 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A3	P33764	101 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	MPI	P34949	423 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	RRAD	P55042	308 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	UCN	P55089	124 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A5	P58743	744 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	LIN54	Q6MZP7	749 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	MISP	Q8IVT2	679 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF561	Q8N587	486 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5J2	Q8NH18	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	THAP6	Q8TBB0	222 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ST7L	Q8TDW4	575 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GLRX2	Q9NS18	164 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	POLE	Q07864	2286 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PRB8	838 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A3	O75751	556 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SC5D	O75845	299 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC6A	O75865	159 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT14	O95848	222 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRA1	P14867	456 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	FPR1	P21462	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXC12	P31275	282 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V1E1	P36543	226 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB5C	P51148	216 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NPRL3	Q12980	569 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR176	Q14439	515 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	HNF4G	Q14541	408 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM163	Q8TC26	289 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	THAP4	Q8WY91	577 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	DIO2	Q92813	273 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	LRR1	Q96L50	414 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGM	Q9H3S5	423 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	EXO5	Q9H790	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	LRFN1	Q9P244	771 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495		H7C1Q1	480 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKY	O43930	277 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00614	P0C842	121 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	RD3L	P0DJH9	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	DDT	P30046	118 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A11	P31949	105 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR9	P51686	369 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	PKIA	P61925	76 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	NHLH2	Q02577	135 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LETMD1-238	ENST00000623495	ST3GAL4	Q11206	333 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms