RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 FGF7P21781 194 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HTR1FP30939 366 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1CBP62140 327 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf27AQ580R0 203 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FCRLAQ7L513 359 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RELTQ969Z4 430 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TCTN2Q96GX1 697 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OCEL1Q9H607 264 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR32O75388 356 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB5P09067 269 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LIPCP11150 499 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ILKQ13418 452 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf63Q68DL7 685 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LCN10Q6JVE6 187 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GATSQ8NAP1 163 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GLTPD2A6NH11 291 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR18Q14330 331 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A6Q92536 515 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CER1O95813 267 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CST2P09228 141 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 Q499Y3 187 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD11Q693B1 232 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A7Q92504 469 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK6Q9Y257 313 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2A25A4D2G3 310 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ARAFP10398 606 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EMP2P54851 167 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2A14Q96R47 310 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CTDSP2O14595 271 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF1BP20333 461 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BSGP35613 385 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR5I1Q13606 314 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BEX5Q5H9J7 111 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TXNDC8Q6A555 127 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IFT22Q9H7X7 185 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GKN1Q9NS71 199 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LEFTY2O00292 366 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NCR1O76036 304 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FUT1P19526 365 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WNT7BP56706 349 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FDX2Q6P4F2 183 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LGI3Q8N145 548 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BET1LQ9NYM9 111 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GNG12Q9UBI6 72 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MPDZO75970 2070 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CD46P15529 392 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-FP30511 346 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ARG2P78540 354 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OSTM1Q86WC4 334 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 VRK3Q8IV63 474 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 INIPQ9NRY2 104 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FZD1Q9UP38 647 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN31Q12999 210 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OXA1LQ15070 435 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR8B8Q15620 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RAB22AQ9UL26 194 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF732B4DXR9 585 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PMCHP20382 165 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FCN2Q15485 313 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CADM3Q8N126 398 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF583Q96ND8 569 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.46□□□□□ -1.38
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