RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 DOK4Q8TEW6 326 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 COQ8BQ96D53 544 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 NPAS1Q99742 590 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SOSTQ9BQB4 213 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 FN3KQ9H479 309 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 PELI2Q9HAT8 420 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 LYRM4Q9HD34 91 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 BIN3Q9NQY0 253 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 HERC2O95714 4834 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PPL8 197 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 GSTA4O15217 222 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SSX5O60225 188 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 OR4F21O95013 312 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ANXA3P12429 323 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 GIFP27352 417 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 RAG2P55895 527 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CRADDP78560 199 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 UNC50Q53HI1 259 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 FAHD1Q6P587 224 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CD200R1Q8TD46 325 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 GPR151Q8TDV0 419 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 AP3S1Q92572 193 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 Q96MT0 163 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 ZNF583Q96ND8 569 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 MNTQ99583 582 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A7Q99884 636 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 RDH8Q9NYR8 311 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 SH3BP4Q9P0V3 963 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GW55 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 ACSM4P0C7M7 580 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L2P0CJ85 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L3P0CJ86 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 SMIM6P0DI80 62 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 TGFBR1P36897 503 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 GSTM5P46439 218 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 IL13RA1P78552 427 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 MAP4K2Q12851 820 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 CSHL1Q14406 222 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 TEX30Q5JUR7 227 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 PCID2Q5JVF3 399 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZSR9 355 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 AHSA2Q719I0 299 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 STPG2Q8N412 459 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 OR2T12Q8NG77 320 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ9Q92806 393 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 C3orf30Q96M34 536 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 OR2M2Q96R28 347 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 GAL3ST1Q99999 423 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 AIF1LQ9BQI0 150 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 ASPNQ9BXN1 380 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 OR51E2Q9H255 320 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 C12orf49Q9H741 205 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 KRT84Q9NSB2 600 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 FBXO34Q9NWN3 711 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-241ENST00000602290 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms