RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCA4	P78363	2273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PR80	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NME4	O00746	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR171	O14626	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF208	O43345	1280 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SPRY2	O43597	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2T1	O43869	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CYTIP	O60759	359 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RAMP1	O60894	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF13	O75888	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LYZL6	O75951	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PMS2P2	O95744	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM107A	O95990	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PRF1	P14222	555 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF43	P17038	809 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FPR3	P25089	353 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HTR2A	P28223	471 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PRDX6	P30041	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GRPR	P30550	384 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	AGTR1	P30556	359 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SSTR2	P30874	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GSK3B	P49841	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GZMM	P51124	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN17	P56750	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOW	P63302	87 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	VEZF1	Q14119	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	EPYC	Q99645	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75

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