RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 RCE1Q9Y256 329 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 CMAHPQ9Y471 501 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 A0A087WUJ7 227 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 A0A096LPE4 126 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PPZ6 126 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TMEM129A0AVI4 362 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 M0R233 179 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 EBAG9O00559 213 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ACOT8O14734 319 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 UPK3AO75631 287 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 OR5F1O95221 314 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SEMG1P04279 462 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 FABP3P05413 133 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 PNMTP11086 282 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 IFI30P13284 250 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 NR4A1P22736 598 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 GRPRP30550 384 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 CALCRP30988 508 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 RRM2P31350 389 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 GPR4P46093 362 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SELENOPP49908 381 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 CCNIQ14094 377 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 DAG1Q14118 895 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 FLOT2Q14254 428 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 MELKQ14680 651 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TRIP10Q15642 601 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 FXNQ16595 210 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 CARD17Q5XLA6 110 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 LCN8Q6JVE9 175 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 NIPAL3Q6P499 406 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ZNF613Q6PF04 617 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 NRMQ8IXM6 262 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 OR51F2Q8NH61 342 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 TMEM239Q8WW34 195 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 SLC38A4Q969I6 547 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ASB9Q96DX5 294 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 C1orf21Q9H246 121 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 VNN3Q9NY84 501 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 POMPQ9Y244 141 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 U3KQV3 271 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-233ENST00000552688 PLCE1Q9P212 2302 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 KCNAB3O43448 404 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 FMO6PO60774 539 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 NPIPB7O75200 414 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 SLC43A1O75387 559 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 PRSS23O95084 383 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 BCL10O95999 233 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 PNPP00491 289 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 HPRP00739 348 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 BGLAPP02818 100 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 GAAP10253 952 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 HLA-DOBP13765 273 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 ZNF43P17038 809 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 MAKP20794 623 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 EPHA1P21709 976 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 AHCYP23526 432 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 P2RY4P51582 365 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-233ENST00000552688 MYBPC1Q00872 1141 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.5 ms