RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 LINC00471Q8N535 108 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 NRIP3Q9NQ35 241 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 H7C417 338 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 DIRAS1O95057 198 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 NDUFB2O95178 105 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 HLA-HP01893 362 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF35P13682 527 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CALCRP30988 508 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR4P46093 362 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB1AP62820 205 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FGD3Q5JSP0 725 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 PERPQ96FX8 193 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 RBP7Q96R05 134 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 WACQ9BTA9 647 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIM15Q9C019 465 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SIAEQ9HAT2 523 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ACOT8O14734 319 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SEC14L2O76054 403 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SERPINA5P05154 406 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FABP6P51161 128 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP5J2P56134 94 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 HGFACQ04756 655 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GK3PQ14409 553 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 EFNB3Q15768 340 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SYT14Q8NB59 555 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 NOX3Q9HBY0 568 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CA10Q9NS85 328 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 UBOX5O94941 541 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 TXNDC12O95881 172 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CELA3BP08861 270 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 BMP4P12644 408 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FPR3P25089 353 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ACVR1BP36896 505 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 IFNGR2P38484 337 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FXYD6P3P58550 94 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 MST1LQ2TV78 715 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM27BQ5VT28 67 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 C1orf198Q9H425 327 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 RRM2P31350 389 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GIPRP48546 466 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GSSP48637 474 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SPIBQ01892 262 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CHRNB3Q05901 458 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC36A2Q495M3 483 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 OR52J3Q8NH60 311 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 NABP1Q96AH0 204 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GPA33Q99795 319 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 BDH2Q9BUT1 245 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 AURKCQ9UQB9 309 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 V9GYQ6 96 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 AQP12BA6NM10 295 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 VSTM5A8MXK1 200 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 IMPA2O14732 288 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB36O95755 333 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 PTHP01270 115 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CD79AP11912 226 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 NR4A1P22736 598 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SDHAP31040 664 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CAPZA2P47755 286 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 FGFBP3Q8TAT2 258 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 SNX18Q96RF0 628 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-203ENST00000547701 UNC119BA6NIH7 251 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 B9A039 149 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ARPC3O15145 178 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 SNAP29O95721 258 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 SERPINF1P36955 418 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 EVX1P49640 407 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ERVK-25P63136 954 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms