RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 OAFQ86UD1 273 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FNDC8Q8TC99 324 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 KCNK17Q96T54 332 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 DOK1Q99704 481 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ALG12Q9BV10 488 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CMAHPQ9Y471 501 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 HSD17B1P14061 328 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RHCEP18577 417 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GLRXP35754 106 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 PDLIM4P50479 330 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GALK2Q01415 458 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CD47Q08722 323 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FHL1Q13642 323 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FXNQ16595 210 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RRM2BQ7LG56 351 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SVOPLQ8N434 492 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RNF148Q8N7C7 305 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 OR51A7Q8NH64 312 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 C1orf198Q9H425 327 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RNF121Q9H920 327 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1W2PRQ8 180 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 INAFM1C9JVW0 142 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CD5LO43866 347 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 LY6HO94772 140 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC2A10O95528 541 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 PTHP01270 115 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 PCSK6P29122 969 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GPR4P46093 362 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 EVX1P49640 407 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 DGCR6Q14129 220 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF519Q8TB69 540 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 C7orf34Q96L11 122 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RBP7Q96R05 134 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SIAEQ9HAT2 523 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NDE1Q9NXR1 346 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CD300AQ9UGN4 299 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 A6NIZ1 184 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFS8O00217 210 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 CDC42EP2O14613 210 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 GPRIN2O60269 458 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RAP1BP61224 184 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 RAP1AP62834 184 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 FMODQ06828 376 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 MSMPQ1L6U9 139 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 ZBED5Q49AG3 693 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 THEM4Q5T1C6 240 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 C16orf89Q6UX73 402 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC18Q8N456 261 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NSMAFQ92636 917 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD8-204ENST00000544999 NABP1Q96AH0 204 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms