RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557		E9PBE3	544 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	PIN1P1	O15428	100 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	TPST2	O60704	377 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	MT-ND5	P03915	603 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	CD55	P08174	381 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	MELTF	P08582	738 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	PUDP	Q08623	228 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	VPS33A	Q96AX1	596 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	RNF121	Q9H920	327 aa		10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
BBS1-222	ENST00000533557	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf98	E9PRG8	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DHH	O43323	396 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TPST1	O60507	370 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SPAG7	O75391	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF205	O95201	554 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CRYBA1	P05813	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CCNO	P22674	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	AHCY	P23526	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MELK	Q14680	651 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZR03	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MAL2	Q969L2	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MGRN1	O60291	552 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	QDPR	P09417	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CRISP3	P54108	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	BTG1	P62324	171 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MOG	Q16653	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0G2JPF8	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PGA4	P0DJD7	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PGA3	P0DJD8	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CRAT	P43155	626 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DSTN	P60981	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZSV7	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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