RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	GATS	Q8NAP1	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DDI1	Q8WTU0	396 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CATSPER2	Q96P56	530 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OXGR1	Q96P68	337 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNA7	Q96RP8	456 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MCHR1	Q99705	422 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ACBD6	Q9BR61	282 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NDE1	Q9NXR1	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GGA2	Q9UJY4	613 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PLLP	Q9Y342	182 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY9	O60503	1353 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCA3	Q99758	1704 aa		3.21	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TNS2	Q63HR2	1409 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GTH9	108 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702		E9PQ18	207 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC7	O00311	574 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GPAA1	O43292	621 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC19A2	O60779	497 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	EED	O75530	441 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SMC2	O95347	1197 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	HCK	P08631	526 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GNB3	P16520	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF3	P17036	446 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFBP5	P24593	272 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ADORA2B	P29275	332 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SHMT2	P34897	504 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GCK	P35557	465 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1D4	P47884	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CSRP3	P50461	194 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	BID	P55957	195 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP5J2	P56134	94 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN18	P56856	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXW4	P57775	412 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ART3	Q13508	389 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	STUM	Q69YW2	141 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZN92	141 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	COPS6	Q7L5N1	327 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM72B	Q86X60	149 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ISOC2	Q96AB3	205 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf72	Q96LT7	481 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SORT1	Q99523	831 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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