RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514271.2

CLIP1-205, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLIP1, Length 3,493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-205ENST00000514271 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 P2RX1P51575 399 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 PHF19Q5T6S3 580 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 PELI1Q96FA3 418 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OR1F2PQ96R84 312 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 ADAM19Q9H013 955 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 A0A087WV62 115 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 RLN2P04090 185 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 THBS1P07996 1170 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 AGAP20933 346 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 RFC3P40938 356 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 PLA2G7Q13093 441 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OSTF1Q92882 214 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OMA1Q96E52 524 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 CACNA1HO95180 2353 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 A0A087X0M5 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 A0A1B0GX30 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 BTN3A3O00478 584 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 ERV3-1Q14264 604 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 TGM7Q96PF1 710 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 ALG8Q9BVK2 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 GPR87Q9BY21 358 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLIP1-205ENST00000514271 DUSP8Q13202 625 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 FAM53BQ14153 422 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 PATE1Q8WXA2 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 TMEM68Q96MH6 324 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 DERL3Q96Q80 235 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-205ENST00000514271 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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