RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	B4GALT1	P15291	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CBR1	P16152	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LBP	P18428	481 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BGN	P21810	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HTR2A	P28223	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC1A6	P48664	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAP2K6	P52564	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SEC24C	P53992	1094 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DSTN	P60981	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PIGF	Q07326	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DAG1	Q14118	895 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GNA13	Q14344	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GSTA3	Q16772	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CFHR4	Q92496	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAL2	Q969L2	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		B4DSR2	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		M0R233	179 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RFXANK	O14593	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC43A1	O75387	559 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ERLIN1	O75477	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RP2	O75695	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	VAMP5	O95183	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MSMB	P08118	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CD79A	P11912	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF43	P17038	809 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EGR1	P18146	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NR4A1	P22736	598 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	COL8A2	P25067	703 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EPHA3	P29320	983 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GRPR	P30550	384 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ARR3	P36575	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CRAT	P43155	626 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAGEB1	P43366	347 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CRISP3	P54108	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AQP5	P55064	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	COPZ1	P61923	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IL13RA1	P78552	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	COL10A1	Q03692	680 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BST1	Q10588	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		Q6ZPA2	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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