RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CTAG2O75638 210 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CLPXO76031 633 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 LIPEQ05469 1076 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 UNC119Q13432 240 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TTC23LQ6PF05 361 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 MREGQ8N565 214 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD1Q8N668 190 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf44Q96CB5 159 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG2Q9Y698 323 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF861PO60384 105 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HUS1O60921 280 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf47O95873 294 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF17P17021 662 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HMOX2P30519 316 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 AQP2P41181 271 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 UQCRFS1P47985 274 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MPPED2Q15777 294 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 AGR3Q8TD06 166 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 FAM210BQ96KR6 192 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TSSK3Q96PN8 268 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM165Q9HC07 324 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS37A4D1T9 235 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 F6UB75 175 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 STOMP27105 288 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 GUCA2BQ16661 112 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NRGNQ92686 78 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LAD1O00515 517 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 BGLAPP02818 100 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA5P05154 406 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NR2C1P13056 603 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF250P15622 560 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN1BP46527 198 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 REG3AQ06141 175 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SELENBP1Q13228 472 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf83Q53S99 150 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CCNJQ5T5M9 372 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 RNF138Q8WVD3 245 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DEC1Q9P2X7 70 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SCN2AQ99250 2005 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PINLYPA6NC86 204 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 A6NDX4 124 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 AIFM1O95831 613 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CCNB1P14635 433 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 FOLR1P15328 257 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CNR1P21554 472 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NMUP48645 174 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TCP10Q12799 353 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PGGHGQ32M88 737 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 XKR4Q5GH76 650 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD13Q7L211 337 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF429Q86V71 674 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MICU2Q8IYU8 434 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N9W7 124 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OR5B3Q8NH48 314 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ACTRT1Q8TDG2 376 aa5.18□□□□□ -1.58
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