RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 CDK20Q8IZL9 346 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SCAIQ8N9R8 606 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SYT14Q8NB59 555 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6X1Q8NH79 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 FOXB1Q99853 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PLK3Q9H4B4 646 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NANSQ9NR45 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF212BA8MTL3 300 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 FFAR1O14842 300 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 DHHO43323 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6A2O95222 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 STAMBPO95630 424 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 BCL10O95999 233 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 CLPTM1O96005 669 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MT-ATP6P00846 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SCG5P05408 212 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PGA4P0DJD7 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PGA3P0DJD8 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 UMPSP11172 480 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 COX4I1P13073 169 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NCK1P16333 377 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NPR2P20594 1047 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MAKP20794 623 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 COL8A2P25067 703 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 IL2RGP31785 369 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 CDAP32320 146 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ARR3P36575 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ALDH3B1P43353 468 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NR4A2P43354 598 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PDLIM4P50479 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TAS2R41P59536 307 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ERVS71-1P61550 626 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 DAG1Q14118 895 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 GGTLC2Q14390 218 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 EFNB3Q15768 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 GSG1Q2KHT4 349 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OTPQ5XKR4 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF627Q7L945 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 C1QL4Q86Z23 238 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MICU2Q8IYU8 434 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NUP37Q8NFH4 326 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM239Q8WW34 195 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ASB10Q8WXI3 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PROX1Q92786 737 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MCHR2Q969V1 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SGTBQ96EQ0 304 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TPD52L3Q96J77 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MPP4Q96JB8 637 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SYT3Q9BQG1 590 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 OR51B6Q9H340 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 TPK1Q9H3S4 243 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 NME4O00746 187 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 IMPA2O14732 288 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 WNT9BO14905 357 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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