RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489772.5

GGA1-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 2

Gene GGA1, Length 1,384 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-222	ENST00000489772	DLL4	Q9NR61	685 aa		9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	CA10	Q9NS85	328 aa		9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	AURKC	Q9UQB9	309 aa		9.63	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	MGRN1	O60291	552 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NDUFB2	O95178	105 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	GADD45G	O95257	159 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SLC2A10	O95528	541 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NPR2	P20594	1047 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SERPINF1	P36955	418 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	IFNGR2	P38484	337 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	OMP	P47874	163 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	LIMS1	P48059	325 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ERVK-25	P63136	954 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	FHL1	Q13642	323 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RAB35	Q15286	201 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SEC23B	Q15437	767 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SLC36A2	Q495M3	483 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	C10orf128	Q5T292	105 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	VHLL	Q6RSH7	139 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	DHFR2	Q86XF0	187 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NUP37	Q8NFH4	326 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SH3GL3	Q99963	347 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SIAE	Q9HAT2	523 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NOX3	Q9HBY0	568 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		9.62	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	CAD	P27708	2225 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TRIM64B	A6NI03	449 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	UNC119B	A6NIH7	251 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772		H7C417	338 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	XKRY	O14609	159 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PTP4A3	O75365	173 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	KRT36	O76013	467 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PDE5A	O76074	875 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	STAMBP	O95630	424 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	IGHV4-39	P01824	125 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SERPINA5	P05154	406 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	CD14	P08571	375 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	OR4A8	P0C604	315 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PATE4	P0C8F1	98 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ATP6V1B2	P21281	511 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RRM2	P31350	389 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	HGFAC	Q04756	655 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	FMOD	Q06828	376 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	DAG1	Q14118	895 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	LCN8	Q6JVE9	175 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF519	Q8TB69	540 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NSMAF	Q92636	917 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	FBXO17	Q96EF6	278 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	FUZ	Q9BT04	418 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RNF121	Q9H920	327 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		9.61	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ACAN	P16112	2415 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZFHX3	Q15911	3703 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772		B9A039	149 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772		H7C1Q1	480 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	AHCYL1	O43865	530 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	OR10H3	O60404	316 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PTH	P01270	115 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	INHBB	P09529	407 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF35	P13682	527 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NR4A1	P22736	598 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	NUDT6	P53370	316 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	GALK2	Q01415	458 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	PLP2	Q04941	152 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	RAB39A	Q14964	217 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	EFNB3	Q15768	340 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	ADIPOQ	Q15848	244 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SGCA	Q16586	387 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		9.6	□□□□□ -0.87
GGA1-222	ENST00000489772	MST1L	Q2TV78	715 aa		9.6	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms