RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MPDZ	O75970	2070 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		M0R1B8	84 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	BHLHE40	O14503	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	GOSR1	O95249	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	CDA	P32320	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	GINS1	Q14691	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ETFDH	Q16134	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	LNX2	Q8N448	690 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	HTRA1	Q92743	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NUAK2	Q9H093	628 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	RNF121	Q9H920	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CTAG2	O75638	210 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	IFNG	P01579	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	HLA-H	P01893	362 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CD3E	P07766	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PRF1	P14222	555 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	NPR2	P20594	1047 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PAX7	P23759	505 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	IGFBP5	P24593	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CRABP1	P29762	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	GRK5	P34947	590 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CRISP1	P54107	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	NR1H2	P55055	460 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PIGF	Q07326	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CIB1	Q99828	191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	FN3K	Q9H479	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SIAH2	O43255	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	MGRN1	O60291	552 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	UBL3	O95164	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RAB36	O95755	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	HRG	P04196	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CTLA4	P16410	223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF3	P17036	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PTAFR	P25105	342 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	GIPR	P48546	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	ESRRG	P62508	458 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	RAB1A	P62820	205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	NRN1L	Q496H8	165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	MDP1	Q86V88	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM34-208	ENST00000485019	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms