RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MCHR2Q969V1 340 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNN2Q9H2S1 579 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 C1orf198Q9H425 327 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM157AC9JC47 383 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 WNT9BO14905 357 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNFRSF1BP20333 461 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 DRD4P21917 467 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM33P57088 247 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 GLO1Q04760 184 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 DPPA2Q7Z7J5 298 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM186Q96B77 213 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRSS27Q9BQR3 290 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 NANOGQ9H9S0 305 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TFP02787 698 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MT-ND1P03886 318 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MSMBP08118 114 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 FUT1P19526 365 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 APLNRP35414 380 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 RAD52P43351 418 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 RUNX1T1Q06455 604 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TSPEARQ8WU66 669 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ECSITQ9BQ95 431 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 INIPQ9NRY2 104 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 C17orf100A8MU93 164 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR7A10O76100 309 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 GAAP10253 952 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 AQP2P41181 271 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MVKQ03426 396 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 MMEL1Q495T6 779 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 AVPI1Q5T686 147 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR51F2Q8NH61 342 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF519Q8TB69 540 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ASB10Q8WXI3 467 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 SGTBQ96EQ0 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF426Q9BUY5 554 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 DECR2Q9NUI1 292 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 ACADSP16219 412 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 UGT2B15P54855 530 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 UCP2P55851 309 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 RABL3Q5HYI8 236 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 STON2Q8WXE9 905 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 SH3GL1Q99961 368 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 BAG5Q9UL15 447 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKRIP1-205ENST00000477886 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC2A10O95528 541 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 MT-ND5P03915 603 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF250P15622 560 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 CDAP32320 146 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR1E2P47887 323 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 CD47Q08722 323 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 SGCAQ16586 387 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC80Q76M96 950 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM239Q8WW34 195 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 NSMAFQ92636 917 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 FBP2O00757 339 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 RP2O75695 350 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 SNAP29O95721 258 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 GZMMP51124 257 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 CRYBA2P53672 197 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 TEKQ02763 1124 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.846e-9■■■■□ 23.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 MOGQ16653 247 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 HIST3H3Q16695 136 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms