RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 GPR141Q7Z602 305 aa6.26□□□□□ -1.41
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SHQ1-207ENST00000475558 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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SHQ1-207ENST00000475558 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.26□□□□□ -1.41
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SHQ1-207ENST00000475558 TMEM45BQ96B21 275 aa6.25□□□□□ -1.41
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SHQ1-207ENST00000475558 TIMP4Q99727 224 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 CALHM2Q9HA72 323 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 B9D1Q9UPM9 204 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-207ENST00000475558 TACC2O95359 2948 aa6.25□□□□□ -1.41
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