RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	MAGEA8	P43361	318 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	BMX	P51813	675 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PNLIPRP2	P54317	469 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SPOCK1	Q08629	439 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PCLAF	Q15004	111 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	OR4D1	Q15615	310 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SGO1	Q5FBB7	561 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	LIPJ	Q5W064	366 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	STEAP4	Q687X5	459 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		Q6ZT83	130 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FCRLA	Q7L513	359 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PDIK1L	Q8N165	341 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	OR52N5	Q8NH56	324 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FAM110B	Q8TC76	370 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	THRSP	Q92748	146 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	EME1	Q96AY2	570 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	MTBP	Q96DY7	904 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RNF145	Q96MT1	663 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	HBEGF	Q99075	208 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	INPP5K	Q9BT40	448 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0J9YW62	118 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		A0A1W2PR80	420 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		A0A1W2PRB8	838 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	OR5H1	A6NKK0	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		B4DXG7	233 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936		E7ESA3	106 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FADS1	O60427	444 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CYTIP	O60759	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF254	O75437	659 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ERLIN1	O75477	346 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RAD51D	O75771	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	DIRAS3	O95661	229 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ANGPTL1	O95841	491 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	HPGD	P15428	266 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CD1D	P15813	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	DCTD	P32321	178 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ELK3	P41970	407 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	SLC15A1	P46059	708 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CAMP	P49913	170 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CAPZA1	P52907	286 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	NME5	P56597	212 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	HILS1	P60008	231 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RAB10	P61026	200 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FHL1	Q13642	323 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CPTP	Q5TA50	214 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CEP170-209	ENST00000464936	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.88	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms