RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RREB1	Q92766	1687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VENTX	O95231	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KRT16	P08779	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNB1	P14635	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VHL	P40337	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB9A	P51151	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TLE4	Q04727	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ASAH1	Q13510	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FGGY	Q96C11	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SNF8	Q96H20	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MYH10	P35580	1976 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HSD17B6	O14756	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CLOCK	O15516	846 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CYTH3	O43739	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC37A4	O43826	429 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC22	O60826	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2J3	O76001	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TDP2	O95551	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TTC4	O95801	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LGI1	O95970	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ABO	P16442	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	IL2RG	P31785	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PHB	P35232	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DDOST	P39656	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGDS	P41222	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A1	P53007	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DGUOK	Q16854	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	COL18A1	P39060	1754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DCC	P43146	1447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DCTN6	O00399	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBTB5	O15062	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GYG2	O15488	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LAT	O43561	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SOX15	O60248	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TBL1X	O60907	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF254	O75437	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR7A10	O76100	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	UGT1A3	P35503	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC1A1	P43005	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RFX3	P48380	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GPM6A	P51674	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC18A1	P54219	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	BID	P55957	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LMO4	P61968	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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