RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SEMA4CQ9C0C4 833 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CDCP1Q9H5V8 836 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MKL2Q9ULH7 1088 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.47■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 XRCC3O43542 346 aa18.47■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 PCGF3Q3KNV8 242 aa18.47■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 FTMTQ8N4E7 242 aa18.47■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MEIOBQ8N635 442 aa18.47■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MCHR2Q969V1 340 aa18.47■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 ETFDHQ16134 617 aa18.47■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 HSPB2Q16082 182 aa18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SLC18B1Q6NT16 456 aa18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R14AQ96A00 147 aa18.46■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 KCNK15Q9H427 330 aa18.46■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ICMTO60725 284 aa18.46■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 GGT3PA6NGU5 568 aa18.45■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 MPC2O95563 127 aa18.45■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 PNPP00491 289 aa18.45■□□□□ 0.54
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IMP4-208ENST00000460766 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.45■□□□□ 0.54
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IMP4-208ENST00000460766 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.45■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 A8MVM7 634 aa18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 FCER2P06734 321 aa18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 IFNGR1P15260 489 aa18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 FAUP35544 74 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 PNLIPRP2P54317 469 aa18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 FOXL2P58012 376 aa18.44■□□□□ 0.54
IMP4-208ENST00000460766 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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