RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRF1Q5T601 910 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LYSMD1Q96S90 227 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UBQLN3Q9H347 655 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 WASF3Q9UPY6 502 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0B4J2A0 478 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C9JQL5 133 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN4O14493 209 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42EP2O14613 210 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A8O95907 504 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4E1P0C645 316 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SRMP19623 302 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPKBP27987 946 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R1BP30154 601 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP2P41181 271 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GLP1RP43220 463 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GAMTQ14353 236 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MST1LQ2TV78 715 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD13Q7L211 337 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IP6K3Q96PC2 410 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC1BQ9P126 229 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LHX3Q9UBR4 397 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTBP11277 2137 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 COL4A3Q01955 1670 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 K7ERQ8 282 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF197O14709 1029 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 CYTIPO60759 359 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 RDH16O75452 317 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 CSTAP01040 98 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNA2P01563 188 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PGAM2P15259 253 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 LTBRP36941 435 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG10P50151 68 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKAG1P54619 331 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF10Q12962 218 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G7Q13093 441 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 SMPDL3AQ92484 453 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.65□□□□□ -1.19
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RABGEF1-203ENST00000439720 H7C1Q1 480 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF6O95976 241 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 CD74P04233 296 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 ARG1P05089 322 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRM4P08173 479 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 SBK2P0C263 348 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 MPC1LP0DKB6 136 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB10P40306 273 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRX1P54821 245 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 HAVCR1Q96D42 359 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 OTUB2Q96DC9 234 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.64□□□□□ -1.19
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