RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PXKQ7Z7A4 578 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM110BQ8TC76 370 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEUROG1Q92886 237 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS33AQ96AX1 596 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TESCQ96BS2 214 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 S100PBPQ96BU1 408 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOAP1Q96BY2 351 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROPN1LQ96C74 230 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF183Q96D59 192 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 DACH2Q96NX9 599 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52B2Q96RD2 323 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52E6Q96RD3 313 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB18Q99592 522 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXD2Q9NVH0 621 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PR80 420 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAGE12JA6NER3 117 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM64A6NGJ6 449 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM64BA6NI03 449 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJE1A6NN92 205 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf97H3BN30 126 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT2B1O00204 365 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGN4O00479 90 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFXANKO14593 260 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF195O14628 629 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMDEC1O15204 470 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDAC3O15379 428 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAMP1O60894 148 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMPD2O60906 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN2BO60939 215 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 AK1P00568 194 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CGAP01215 116 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRHP06850 196 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GKN3PP0CG01 181 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR2F1P10589 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD99P14209 185 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGCP20142 388 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 UQCRC2P22695 453 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYGSP22914 178 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCTDP32321 178 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRATP43155 626 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH12P55289 794 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARD18P57730 90 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOVP59797 346 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSTNP60981 165 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXC5Q00444 222 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASP8Q14790 479 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL2A1Q16548 175 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTA3Q16772 222 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL26Q53HC5 615 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTMPQ5BVD1 217 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOXA1Q86UR1 476 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF575Q86XF7 245 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 VRK2Q86Y07 508 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CADM2Q8N3J6 435 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRACQ8N912 160 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5W2Q8NH69 310 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR119Q8TDV5 335 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms