RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PLPP5Q8NEB5 264 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PIGKQ92643 395 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 RTN4RQ9BZR6 473 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TXNIPQ9H3M7 391 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SLC17A5Q9NRA2 495 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R10Q9NYW0 307 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TVP23AA6NH52 213 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ANXA2P2A6NMY6 339 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 XRCC3O43542 346 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 FADS1O60427 444 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 IL5P05113 134 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ITPKBP27987 946 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 KCNAB1Q14722 419 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TOMM20Q15388 145 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB37Q5TC79 503 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GRINAQ7Z429 371 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 MARCH3Q86UD3 253 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR1L3Q8NH93 324 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ORAI1Q96D31 301 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OMA1Q96E52 524 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R8Q9NYW2 309 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 MPDZO75970 2070 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 DUX1O43812 170 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 OR2T1O43869 369 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CPN1P15169 458 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CXCL3P19876 107 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CDK2P24941 298 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R20P59543 309 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 GPLD1P80108 840 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SLC17A1Q14916 467 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 NSDHLQ15738 373 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 PM20D2Q8IYS1 436 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ZNF679Q8IYX0 411 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SPICQ8N5J4 248 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 BMPERQ8N8U9 685 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 RNF128Q8TEB7 428 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 THEM6Q8WUY1 208 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 DLL4Q9NR61 685 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SPTBP11277 2137 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 GMDSO60547 372 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 PIAS2O75928 621 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 PER3P56645 1201 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 PRR22Q8IZ63 422 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 PRSS35Q8N3Z0 413 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ZNF454Q8N9F8 522 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TMEM106AQ96A25 262 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TMED7Q9Y3B3 224 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GX78 115 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SSNA1O43805 119 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ABCD3P28288 659 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 FAUP35544 74 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB1P43366 347 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 GPR119Q8TDV5 335 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC3Q9BQ90 382 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SLC23A1Q9UHI7 598 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SNRPGP15A8MWD9 76 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 H7C1C5 153 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SUSD5O60279 629 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CD37P11049 281 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SOX2P48431 317 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 LCN6P62502 163 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD16Q6P6B7 361 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ADGRG3Q86Y34 549 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 SORCS2Q96PQ0 1159 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 KIR3DL2P43630 455 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 DLX5P56178 289 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 CLDN12P56749 244 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 ACKR1Q16570 336 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 C1orf140Q5VVS0 124 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 TGIF2Q9GZN2 237 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-205ENST00000409985 KLK11Q9UBX7 282 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms