RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35B4Q969S0 331 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TLDC2A0PJX2 215 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf98E9PRG8 122 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 DHHO43323 396 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 NGFP01138 241 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PTHP01270 115 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CCNOP22674 350 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 COMTD1Q86VU5 262 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SPICQ8N5J4 248 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PLSCR5A0PG75 271 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 RFXANKO14593 260 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN15O95858 294 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 CRYBA1P05813 215 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADH4P08319 380 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SELEP16581 610 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PLP2Q04941 152 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SLC36A2Q495M3 483 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 GTDC1Q4AE62 458 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM155Q4W5P6 130 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 OR6X1Q8NH79 312 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA7O95182 113 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT7P0C024 238 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADORA3P0DMS8 318 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 APLNRP35414 380 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 WNT5AP41221 380 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PAX2Q02962 417 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MELKQ14680 651 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ULK3Q6PHR2 472 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 UPRTQ96BW1 309 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 EPYCQ99645 322 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 NUF2Q9BZD4 464 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM13Q9H4Q3 707 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH7Q9H992 704 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MSL2Q9HCI7 577 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 AIG1Q9NVV5 245 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 OR5V1Q9UGF6 321 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SRRM5B3KS81 715 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ENTPD5O75356 428 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 CD55P08174 381 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 QDPRP09417 244 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MYZAPP0CAP1 466 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAL4GP0DN37 164 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYND11Q15326 602 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TAF9Q16594 264 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC18Q8N456 261 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 VPS33AQ96AX1 596 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 CHIAQ9BZP6 476 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ESCO2Q56NI9 601 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 OR5J2Q8NH18 312 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD12-201ENST00000404162 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms