RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391014.1

RNU6-1228P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1228, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1228P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PIANPQ8IYJ0 282 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TMEM256Q8N2U0 113 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM71CQ8NEG0 241 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SGK3Q96BR1 496 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WDR34Q96EX3 536 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 VPS35Q96QK1 796 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RSG1Q9BU20 258 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GSDMCQ9BYG8 508 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DUSP21Q9H596 190 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF442Q9H7R0 627 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FN3KRPQ9HA64 309 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EPS15L1Q9UBC2 864 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RASD1Q9Y272 281 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ICE1Q9Y2F5 2266 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 A0A0U1RQV5 110 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CFAP73A6NFT4 308 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 H0YJW9 148 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CHMP2AO43633 222 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PFKFB2O60825 505 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TOM1L1O75674 476 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PALMO75781 387 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CNMDO75829 334 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MBD3O95983 291 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 LHBP01229 141 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IGHG4P01861 327 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CAPN1P07384 714 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CGB7P0DN87 165 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AHCYP23526 432 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 VGLL4Q14135 290 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PON2Q15165 354 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RGNQ15493 299 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF181Q2M3W8 571 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ORMDL2Q53FV1 153 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 XKR7Q5GH72 579 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM71F2Q6NXP2 309 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ARL9Q6T311 187 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PGAP1Q75T13 922 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC16A13Q7RTY0 426 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MOB3BQ86TA1 216 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC65Q8IXS2 484 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC170Q8IYT3 715 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CLEC4FQ8N1N0 589 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CLDN19Q8N6F1 224 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CEP112Q8N8E3 955 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C12orf42Q96LP6 360 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 METTL7AQ9H8H3 244 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ACTR8Q9H981 624 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IL37Q9NZH6 218 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KIAA1257Q9ULG3 409 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 B9D1Q9UPM9 204 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MSH6P52701 1360 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 F5H6K3 240 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 H7C417 338 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CTAGE5O15320 804 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZSCAN12O43309 604 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AQP9O43315 295 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TIMM44O43615 452 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SCELO95171 688 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCNB1P14635 433 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ATP5DP30049 168 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CEACAM6P40199 344 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAP3K8P41279 467 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NPBWR2P48146 333 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RFX3P48380 749 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PLA2G16P53816 162 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CRADDP78560 199 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KLRC3Q07444 240 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RPA4Q13156 261 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAB21L1Q13394 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MESDQ14696 234 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ARHGAP19Q14CB8 494 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OXA1LQ15070 435 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TEX30Q5JUR7 227 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ETFRF1Q6IPR1 90 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 H3F3CQ6NXT2 135 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NIPAL3Q6P499 406 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRSS54Q6PEW0 395 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ASCL5Q7RTU5 278 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RABEPKQ7Z6M1 372 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WDFY1Q8IWB7 410 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 BCORP1Q8N888 145 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ACOT4Q8N9L9 421 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR56B1Q8NGI3 324 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR6N1Q8NGY5 312 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms