RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373387.8

GARNL3-202, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GARNL3, Length 3,800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-202ENST00000373387 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 UBE2QL1A1L167 161 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 RNF222A6NCQ9 220 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 GOSR2O14653 212 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 WISP1O95388 367 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PNPP00491 289 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 IGHMP01871 453 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CD3DP04234 171 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 MYOGP15173 224 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 MGMTP16455 207 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 POU3F4P49335 361 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PGDP52209 483 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ALG10Q5BKT4 473 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CBLN3Q6UW01 205 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 A0A1W2PPC1 479 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 POM121CA8CG34 1229 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PMS2P2O95744 297 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 MAS1P04201 325 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 NTSR1P30989 418 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR10G6Q8NH81 332 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 COQ8AQ8NI60 647 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 RNF128Q8TEB7 428 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 FGF14Q92915 247 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 FBXW5Q969U6 566 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 FAM117AQ9C073 453 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR10A5Q9H207 317 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 Q9N2J8 555 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR14I1A6ND48 311 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 PHYHO14832 338 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SDC3O75056 442 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 IL33O95760 270 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 IL2RAP01589 272 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR4E1P0C645 316 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ST6GAL1P15907 406 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SOX2P48431 317 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CTXN1P60606 82 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CTAG1AP78358 180 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 KCNAB1Q14722 419 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ASB5Q8WWX0 329 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TAAR8Q969N4 342 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ARL6Q9H0F7 186 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 WBP1LQ9NX94 342 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 NPIPB7O75200 414 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 GPANK1O95872 356 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 YPEL5P62699 121 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 BTG2P78543 158 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 SLC17A1Q14916 467 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 GALNT16Q8N428 558 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 ST8SIA2Q92186 375 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-202ENST00000373387 THRSPQ92748 146 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms