RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CTSFQ9UBX1 484 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 X6R8D5 127 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 REV3LO60673 3130 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0A6YYH2 397 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM218A2RU14 115 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 A6NJ64 397 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42EP2O14613 210 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH8O95206 1070 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RLN2P04090 185 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 F13BP05160 661 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 S100A6P06703 90 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DRD3P35462 400 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GPR1P46091 355 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HCCSP53701 268 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 H2BFSP57053 126 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R19P59542 299 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-25P63136 954 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CRMP1Q14194 572 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 Q499Y3 187 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 AGBL4Q5VU57 503 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD13Q7L211 337 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FCRLAQ7L513 359 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 AMZ2Q86W34 360 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR2L5Q8NG80 312 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ASB12Q8WXK4 309 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR14A2Q96R54 314 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SEC11CQ9BY50 192 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR2AG1Q9H205 316 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EXO5Q9H790 373 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KLK11Q9UBX7 282 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQF6 199 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FCER2P06734 321 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 F3P13726 295 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FOLR2P14207 255 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDK2P24941 298 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NAAAQ02083 359 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SGCGQ13326 291 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LTB4RQ15722 352 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NRROSQ86YC3 692 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR6S1Q8NH40 331 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RAB24Q969Q5 203 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DERL3Q96Q80 235 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NOX4Q9NPH5 578 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C5AR2Q9P296 337 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GNG8Q9UK08 70 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 F5P12259 2224 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GGT3PA6NGU5 568 aa6.52□□□□□ -1.37
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