RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354452.7

TCF4-201, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 3,482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-201ENST00000354452 SEC16AO15027 2179 aa16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CCR2P41597 374 aa16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 DNASE1L1P49184 302 aa16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 IL10RAQ13651 578 aa16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ADAM11O75078 769 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 DNAJB6O75190 326 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 DAOP14920 347 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CLINT1Q14677 625 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 PARGQ86W56 976 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 BAP18Q8IXM2 172 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 MRI1Q9BV20 369 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 UQCC1Q9NVA1 299 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 GHRLQ9UBU3 117 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 RTTNQ86VV8 2226 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 MED6O75586 246 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 LY86O95711 162 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 NUDT14O95848 222 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 GNALP38405 381 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CDK3Q00526 305 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 METRNLQ641Q3 311 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 PHYHIPQ92561 330 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 MYO9BQ13459 2157 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ICOSLGO75144 302 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CSRP2Q16527 193 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 TCTN1Q2MV58 587 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 OR2L3Q8NG85 312 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 CMTM3Q96MX0 182 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.09■□□□□ 0.17
TCF4-201ENST00000354452 ZNF749O43361 778 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 OLFM2O95897 454 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 EMDP50402 254 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 TRIM2Q9C040 744 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 FLRT3Q9NZU0 649 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 F5P12259 2224 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 CSTAP01040 98 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ADCYAP1P18509 176 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SLC2A5P22732 501 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 HAAOP46952 286 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 PPP1R1AQ13522 171 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 MPPED2Q15777 294 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 OR52W1Q6IF63 320 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 UQCC3Q6UW78 93 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 PGAP1Q75T13 922 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 RHOFQ9HBH0 211 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.08■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 CPED1A4D0V7 1026 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SFTPBP07988 381 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 NGFRP08138 427 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SPARCP09486 303 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 PI3P19957 117 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 RAB6AP20340 208 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ENPP2Q13822 863 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 OR4N2Q8NGD1 307 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SPSB2Q99619 263 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 PRR13Q9NZ81 148 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 LY6G6FQ5SQ64 297 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SMARCD2Q92925 531 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ZNF681Q96N22 645 aa16.07■□□□□ 0.16
TCF4-201ENST00000354452 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms