RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339298.2

SOCS4-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS4, Length 6,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4-201ENST00000339298 OR9G9P0C7N8 305 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CST5P28325 142 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 NUDT2P50583 147 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MAXP61244 160 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 OPCMLQ14982 345 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CDKN3Q16667 212 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 XKR7Q5GH72 579 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 NOTUMQ6P988 496 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TRIM40Q6P9F5 258 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 WFDC12Q8WWY7 111 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SLC25A28Q96A46 364 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CHFRQ96EP1 664 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF670Q9BS34 389 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GCM1Q9NP62 436 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PISDQ9UG56 409 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MMACHCQ9Y4U1 282 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CLDN16Q9Y5I7 305 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 U3KQE9 123 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ABCC1P33527 1531 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 EFCAB6Q5THR3 1501 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 A0A1W2PN81 502 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GFRA2O00451 464 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MAP2K7O14733 419 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ERI3O43414 337 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CIAO1O76071 339 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF205O95201 554 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PMP2P02689 132 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 FABP2P12104 132 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CRHR1P34998 444 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PTGER4P35408 488 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CHRNA7P36544 502 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GNG5P63218 68 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CNTN2Q02246 1040 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 IRF3Q14653 427 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PCK2Q16822 640 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GDF7Q7Z4P5 450 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 FBXL14Q8N1E6 418 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 BCORP1Q8N888 145 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 CMTM2Q8TAZ6 248 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SH3RF2Q8TEC5 729 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 BRI3BPQ8WY22 251 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 C20orf27Q9GZN8 174 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 OR51J1Q9H342 316 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 GHRLQ9UBU3 117 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TINAGQ9UJW2 476 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ABCA7Q8IZY2 2146 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 DCCP43146 1447 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 A0A0U1RQV1 116 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MEIOCA2RUB1 952 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM150BA6NC51 233 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF726A6NNF4 738 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 HSD17B6O14756 317 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 UBE2L6O14933 153 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MBTPS2O43462 519 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 XPNPEP2O43895 674 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 FTH1P19P0C7X4 201 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PI3P19957 117 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 DDTP30046 118 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 KIR2DL3P43628 341 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 ATP5J2P56134 94 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 PMP22Q01453 160 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 NPTX1Q15818 432 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 IQCJQ1A5X6 159 aa2.95□□□□□ -1.94
SOCS4-201ENST00000339298 MIDNQ504T8 468 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms