RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 MXRA7P84157 204 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 NRN1LQ496H8 165 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ALG10Q5BKT4 473 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TUBA1AQ71U36 451 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 HDDC2Q7Z4H3 204 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MUC13Q9H3R2 512 aa22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 DHHO43323 396 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 PTP4A3O75365 173 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CECR9P0C854 216 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ACADSP16219 412 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ATP6V1B2P21281 511 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 EFNA4P52798 201 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SEC23BQ15437 767 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 C10orf128Q5T292 105 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 LCN8Q6JVE9 175 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 KCNK17Q96T54 332 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TMEM5Q9Y2B1 443 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.12■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SEC14L2O76054 403 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 DIRAS1O95057 198 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ARR3P36575 388 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MAGEA2P43356 314 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 NAAAQ02083 359 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MTX3Q5HYI7 312 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 OAFQ86UD1 273 aa22.11■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZNF519Q8TB69 540 aa22.11■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 MCHR2Q969V1 340 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZNF347Q96SE7 839 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 NOX3Q9HBY0 568 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.11■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 QDPRP09417 244 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 B4GALT1P15291 398 aa22.1■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 MS4A2Q01362 244 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CHRNB3Q05901 458 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MDP1Q86V88 176 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 OR51A7Q8NH64 312 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.1■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MOKQ9UQ07 419 aa22.1■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 48.1
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RP9-201ENST00000297157 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CALCRP30988 508 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 GPR4P46093 362 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 HMGA2P52926 109 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZBED5Q49AG3 693 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CDK20Q8IZL9 346 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ALG12Q9BV10 488 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.09■■□□□ 1.13
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RP9-201ENST00000297157 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.09■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 VWC2LB2RUY7 222 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MCIDASD6RGH6 385 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MGRN1O60291 552 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 HLA-HP01893 362 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 FABP3P05413 133 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 USF1P22415 310 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 SMIM11AP58511 58 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 FXYD6P3P58550 94 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CTXN1P60606 82 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 MST1LQ2TV78 715 aa22.08■■□□□ 1.13
RP9-201ENST00000297157 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.08■■□□□ 1.13
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