RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CTLA4P16410 223 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PEX2P28328 305 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF84P51523 738 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RAD23AP54725 363 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NPRL3Q12980 569 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TBRG1Q3YBR2 411 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LEG1Q6P5S2 330 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 DACH2Q96NX9 599 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SH3D21A4FU49 640 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR6C68A6NDL8 312 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 E9PQ18 207 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SURF4O15260 269 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 IFNGP01579 166 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF3P17036 446 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 EPHA2P29317 976 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC34A1Q06495 639 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TAB1Q15750 504 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RDH12Q96NR8 316 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TEX12Q9BXU0 123 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NUAK2Q9H093 628 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 FKBP7Q9Y680 259 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA4P78363 2273 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 B4GALT1P15291 398 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CRABP1P29762 137 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DL3P43628 341 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CRMP1Q14194 572 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LPCAT4Q643R3 524 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C12orf73Q69YU5 71 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR6V1Q8N148 313 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 WDR31Q8NA23 367 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01560Q8TB33 94 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 FAM222BQ8WU58 562 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B8Q92506 261 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NSMAFQ92636 917 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MED18Q9BUE0 208 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 B9D1Q9UPM9 204 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CADP27708 2225 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 DCTN6O00399 190 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 SLC16A7O60669 478 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 SEC14L2O76054 403 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 THBDP07204 575 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 EPXP11678 715 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 NPR2P20594 1047 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 PAX7P23759 505 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 HOXC12P31275 282 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A1P53007 311 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms