RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ADH1BP00325 375 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 AKAIN1P0CW23 69 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS3P35030 304 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR1Q1Q15612 314 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PXKQ7Z7A4 578 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF511Q8NB15 262 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR6S1Q8NH40 331 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 TIMP4Q99727 224 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 APMAPQ9HDC9 416 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 EFEMP2O95967 443 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 THY1P04216 161 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 MPGP29372 298 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 TSC22D1Q15714 1073 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 AGBL4Q5VU57 503 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 MRGPREQ86SM8 312 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OOSP2Q86WS3 158 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 FAM219AQ8IW50 185 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NR4A3Q92570 626 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SPSB2Q99619 263 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ATRXP46100 2492 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PQF6 199 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PR48 441 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF28P17035 718 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ACTA2P62736 377 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ACTG2P63267 376 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PLA2G7Q13093 441 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 CLINT1Q14677 625 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NUBPLQ8TB37 319 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35A4Q96G79 324 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NMNAT3Q96T66 252 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 CHRDQ9H2X0 955 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 UPB1Q9UBR1 384 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 MAFFQ9ULX9 164 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 IMPA2O14732 288 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 AIFM1O95831 613 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 IFNA4P05014 189 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR4E1P0C645 316 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 GAAP10253 952 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 RPA2P15927 270 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ATP1B3P54709 279 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR2B8PP59922 312 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 BTN3A2P78410 334 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf189Q5VU69 101 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 LNX2Q8N448 690 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR1J2Q8NGS2 313 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 GAREM1Q9H706 876 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 GHRLQ9UBU3 117 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PEX12O00623 359 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 CTDSPLO15194 276 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PIN1P1O15428 100 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SULT1B1O43704 296 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 ZFPL1O95159 310 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 PAPLNO95428 1278 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 NQO2P16083 231 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 AKR1C4P17516 323 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 SLC6A6P31641 620 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 TGIF1Q15583 401 aa9.87□□□□□ -0.83
CNGA3-201ENST00000272602 STPG1Q5TH74 334 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms