RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ERV3-1Q14264 604 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GRM7Q14831 915 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CD226Q15762 336 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 KLHL26Q53HC5 615 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF524Q96C55 264 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 H3BUI4 141 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PNMTP11086 282 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GDI1P31150 447 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PBX2P40425 430 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ALG11Q2TAA5 492 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 LRFN4Q6PJG9 635 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PXT1Q8NFP0 134 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GPX8Q8TED1 209 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ASB13Q8WXK3 278 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CCR4P51679 360 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 BTG2P78543 158 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RAB11BQ15907 218 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ETFDHQ16134 617 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OTPQ5XKR4 325 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ASPHD2Q6ICH7 369 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CBLN3Q6UW01 205 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF440Q8IYI8 595 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ASB12Q8WXK4 309 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 INTS14Q96SY0 518 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC38A3Q99624 504 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SYT4Q9H2B2 425 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 KCNG2Q9UJ96 466 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CLDN16Q9Y5I7 305 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HRH3Q9Y5N1 445 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC17A2O00624 439 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PMS2P2O95744 297 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 APOC3P02656 99 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MELTFP08582 738 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR4E1P0C645 316 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ACHEP22303 614 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 NTSR1P30989 418 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CCKBRP32239 447 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EMC4Q5J8M3 183 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FNDC7Q5VTL7 733 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ST8SIA2Q92186 375 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 DGAT2Q96PD7 388 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MNTQ99583 582 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ATG5Q9H1Y0 275 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR10A5Q9H207 317 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.5□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PQF6 199 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC5O15389 551 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 WDPCPO95876 746 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MGMTP16455 207 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM166AQ6J272 317 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM82A0PJX8 343 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RAD1O60671 282 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RENP00797 406 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UBBP0CG47 229 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ST6GAL1P15907 406 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UBA52P62987 128 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SKP2Q13309 424 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HYAL4Q2M3T9 481 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF546Q86UE3 836 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms