RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 A0A0B4J203 849 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 BCKDHBP21953 392 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CALCRP30988 508 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MTCP1P56278 107 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GPR171O14626 319 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CSNK1DP48730 415 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PPP5D1E7EU14 171 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 BET1O15155 118 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RAB35Q15286 201 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SOCS7O14512 581 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF266Q14584 549 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SHEQ5VZ18 495 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 NECAP1Q8NC96 275 aa9.4□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR6C76A6NM76 312 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 HOXA9P31269 272 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 TEKQ02763 1124 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 OR2T2Q6IF00 324 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 UCN3Q969E3 161 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 VSTM5A8MXK1 200 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SUSD5O60279 629 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 CD80P33681 288 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 TMED6Q8WW62 240 aa9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 TOX4O94842 621 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 LGI1O95970 557 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ZNF728P0DKX0 622 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SRPXP78539 464 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 CLDND1Q9NY35 253 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 LRRC18Q8N456 261 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 P2RY2P41231 377 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 PAX6P26367 422 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 H3F3AP84243 136 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 MELKQ14680 651 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 FAHD1Q6P587 224 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 DDAH2O95865 285 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ZNF511Q8NB15 262 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 ZFP92A6NM28 416 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 FXYD1O00168 92 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 HPNP05981 417 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 MMP2P08253 660 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SOX18P35713 384 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 POM121Q96HA1 1249 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 PRO1933Q9H354 126 aa9.39□□□□□ -0.91
TTL-201ENST00000233336 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms