RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RASD2Q96D21 266 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CBFA2T3O75081 653 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PSKH1P11801 424 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 BMP5P22003 454 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CX3CR1P49238 355 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C21orf58P58505 322 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF45Q02386 682 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF117Q03924 483 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 KLRB1Q12918 225 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF141Q15928 474 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DUSP7Q16829 419 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR6V1Q8N148 313 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CBX7O95931 251 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 UBBP0CG47 229 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PHYHIPQ92561 330 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C10orf90Q96M02 699 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GNRHR2Q96P88 292 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 EMC6Q9BV81 110 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 HES7Q9BYE0 225 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CD300AQ9UGN4 299 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 V9GY05 133 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A0A1B0GVC2 190 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PQ09 198 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 LIFP15018 202 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 BMXP51813 675 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DUSP2Q05923 314 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TPRA1Q86W33 373 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ARHGDIGQ99819 225 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PRSS37A4D1T9 235 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 H7C417 338 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MASP2O00187 686 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TNFRSF1AP19438 455 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF91Q05481 1191 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GAB4Q2WGN9 574 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR2M7Q8NG81 312 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 FUZQ9BT04 418 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A0A087WUJ7 227 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RNF212BA8MTL3 300 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PRSS3P35030 304 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 FUT7Q11130 342 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 FZD5Q13467 585 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MEP1BQ16820 701 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 KDM8Q8N371 416 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR10D3Q8NH80 312 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C5orf49A4QMS7 147 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CCL21O00585 134 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SCGB1D2O95969 90 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF17P17021 662 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SERPINA2P20848 420 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ACHEP22303 614 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 S100A7P31151 101 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GSG1Q2KHT4 349 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ESCO2Q56NI9 601 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 HES5Q5TA89 166 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF709Q8N972 641 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 THAP6Q8TBB0 222 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 FOXB1Q99853 325 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CLDN24A6NM45 220 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CYR61O00622 381 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ALPLP05186 524 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CD3EP07766 207 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms