RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 TM9SF2Q99805 663 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 KLK13Q9UKR3 277 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 MED13Q9UHV7 2174 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF726A6NNF4 738 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CEACAM4O75871 244 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SULT1C4O75897 302 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GPANK1O95872 356 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CD1AP06126 327 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TACSTD2P09758 323 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ENPP1P22413 925 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 MAGEA5P43359 124 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 STARP49675 285 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TNFSF10P50591 281 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CLRN1P58418 232 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SIRPAP78324 504 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 FABP5Q01469 135 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 FMODQ06828 376 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SLC17A1Q14916 467 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 HIST3H3Q16695 136 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 UCN2Q96RP3 112 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TMED9Q9BVK6 235 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TIGARQ9NQ88 270 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GNG8Q9UK08 70 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.97□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.96□□□□□ -0.01
TVP23C-201ENST00000225576 METTL15A6NJ78 407 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 FAM166BA8MTA8 275 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 H0YC42 278 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 EFSO43281 561 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LRRTM2O43300 516 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 HRGP04196 525 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NR2C1P13056 603 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RFC3P40938 356 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TGM4P49221 684 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ENTPD1P49961 510 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CLDN15P56746 228 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CAMK2DQ13557 499 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TEX30Q5JUR7 227 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ARL9Q6T311 187 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR10D3Q8NH80 312 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KCTD7Q96MP8 289 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.96□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 HSPB2A8KAH6 182 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PRR32B1ATL7 298 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GABRPO00591 440 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CXCL13O43927 109 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KRT8P05787 483 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CELA3AP09093 270 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CLDN17P56750 224 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ADAM8P78325 824 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CDK5R1Q15078 307 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 HSPB2Q16082 182 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MOGQ16653 247 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PCK2Q16822 640 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 C22orf42Q6IC83 251 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RPTNQ6XPR3 784 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 THEM6Q8WUY1 208 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms